Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccnd3P30282 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnd3P30282 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnd3P30282 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms