Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtgfP29268 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtgfP29268 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtgfP29268 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtgfP29268 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtgfP29268 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CtgfP29268 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CtgfP29268 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms