Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa2P28309 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa2P28309 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa2P28309 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa2P28309 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Defa2P28309 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Defa2P28309 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms