Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LoxP28301 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LoxP28301 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LoxP28301 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LoxP28301 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LoxP28301 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LoxP28301 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LoxP28301 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LoxP28301 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LoxP28301 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LoxP28301 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LoxP28301 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LoxP28301 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LoxP28301 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LoxP28301 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LoxP28301 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LoxP28301 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LoxP28301 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LoxP28301 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LoxP28301 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LoxP28301 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LoxP28301 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LoxP28301 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LoxP28301 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LoxP28301 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LoxP28301 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LoxP28301 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LoxP28301 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LoxP28301 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LoxP28301 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LoxP28301 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LoxP28301 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LoxP28301 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LoxP28301 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LoxP28301 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LoxP28301 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LoxP28301 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LoxP28301 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LoxP28301 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LoxP28301 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LoxP28301 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LoxP28301 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LoxP28301 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LoxP28301 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LoxP28301 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LoxP28301 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LoxP28301 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LoxP28301 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms