Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lef1P27782 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lef1P27782 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms