Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms