Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myf5P24699 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myf5P24699 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myf5P24699 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myf5P24699 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myf5P24699 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Myf5P24699 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms