Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggta1P23336 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ggta1P23336 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms