Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefhP19246 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefhP19246 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefhP19246 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NefhP19246 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefhP19246 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefhP19246 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefhP19246 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefhP19246 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefhP19246 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefhP19246 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefhP19246 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefhP19246 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NefhP19246 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefhP19246 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefhP19246 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefhP19246 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefhP19246 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefhP19246 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefhP19246 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefhP19246 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefhP19246 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefhP19246 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefhP19246 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefhP19246 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefhP19246 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NefhP19246 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NefhP19246 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefhP19246 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefhP19246 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefhP19246 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefhP19246 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefhP19246 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefhP19246 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NefhP19246 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefhP19246 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefhP19246 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefhP19246 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefhP19246 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NefhP19246 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefhP19246 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefhP19246 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefhP19246 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefhP19246 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefhP19246 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefhP19246 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefhP19246 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NefhP19246 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefhP19246 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefhP19246 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NefhP19246 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NefhP19246 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NefhP19246 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NefhP19246 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NefhP19246 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NefhP19246 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NefhP19246 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NefhP19246 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NefhP19246 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NefhP19246 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NefhP19246 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NefhP19246 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NefhP19246 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NefhP19246 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NefhP19246 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NefhP19246 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NefhP19246 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NefhP19246 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NefhP19246 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NefhP19246 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NefhP19246 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NefhP19246 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NefhP19246 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NefhP19246 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NefhP19246 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NefhP19246 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NefhP19246 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NefhP19246 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NefhP19246 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NefhP19246 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NefhP19246 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NefhP19246 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NefhP19246 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NefhP19246 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NefhP19246 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms