Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RargP18911 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RargP18911 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RargP18911 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RargP18911 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RargP18911 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RargP18911 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RargP18911 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RargP18911 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RargP18911 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RargP18911 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RargP18911 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RargP18911 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RargP18911 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RargP18911 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RargP18911 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RargP18911 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RargP18911 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RargP18911 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RargP18911 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RargP18911 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RargP18911 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RargP18911 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RargP18911 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RargP18911 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RargP18911 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RargP18911 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RargP18911 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RargP18911 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RargP18911 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RargP18911 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RargP18911 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RargP18911 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RargP18911 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RargP18911 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RargP18911 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RargP18911 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RargP18911 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RargP18911 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RargP18911 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RargP18911 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RargP18911 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RargP18911 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RargP18911 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RargP18911 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RargP18911 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RargP18911 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RargP18911 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RargP18911 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RargP18911 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RargP18911 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RargP18911 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RargP18911 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RargP18911 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RargP18911 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RargP18911 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RargP18911 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RargP18911 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RargP18911 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RargP18911 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RargP18911 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RargP18911 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RargP18911 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RargP18911 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RargP18911 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RargP18911 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RargP18911 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RargP18911 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RargP18911 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms