Protein–RNA interactions for Protein: P18419

Svs4, Seminal vesicle secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs4P18419 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Svs4P18419 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Svs4P18419 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Svs4P18419 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Svs4P18419 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Svs4P18419 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Svs4P18419 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Svs4P18419 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Svs4P18419 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Svs4P18419 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Svs4P18419 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Svs4P18419 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Svs4P18419 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Svs4P18419 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Svs4P18419 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Svs4P18419 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms