Protein–RNA interactions for Protein: P18111

Cdx1, Homeobox protein CDX-1, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx1P18111 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdx1P18111 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx1P18111 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx1P18111 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx1P18111 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx1P18111 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx1P18111 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx1P18111 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms