Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms