Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb1P13372 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb1P13372 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms