Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl1P10146 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms