Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UbbP0CG49 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms