Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Surf1P09925 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf1P09925 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf1P09925 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf1P09925 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Surf1P09925 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Surf1P09925 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms