Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna9P09235 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna9P09235 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms