Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtaP09225 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtaP09225 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtaP09225 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LtaP09225 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LtaP09225 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtaP09225 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtaP09225 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtaP09225 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtaP09225 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtaP09225 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtaP09225 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtaP09225 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtaP09225 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtaP09225 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtaP09225 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtaP09225 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtaP09225 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtaP09225 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtaP09225 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtaP09225 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtaP09225 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtaP09225 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtaP09225 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtaP09225 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtaP09225 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtaP09225 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtaP09225 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtaP09225 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LtaP09225 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtaP09225 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtaP09225 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtaP09225 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtaP09225 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtaP09225 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtaP09225 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtaP09225 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtaP09225 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtaP09225 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtaP09225 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtaP09225 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtaP09225 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtaP09225 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtaP09225 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtaP09225 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtaP09225 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtaP09225 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtaP09225 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtaP09225 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LtaP09225 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtaP09225 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtaP09225 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtaP09225 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtaP09225 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtaP09225 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtaP09225 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtaP09225 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtaP09225 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtaP09225 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtaP09225 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtaP09225 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtaP09225 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtaP09225 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtaP09225 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtaP09225 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtaP09225 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtaP09225 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtaP09225 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtaP09225 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtaP09225 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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