Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc8P09025 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc8P09025 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms