Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms