Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtrP07309 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtrP07309 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtrP07309 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtrP07309 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtrP07309 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtrP07309 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtrP07309 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtrP07309 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtrP07309 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtrP07309 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtrP07309 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtrP07309 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtrP07309 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtrP07309 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtrP07309 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtrP07309 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtrP07309 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtrP07309 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TtrP07309 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TtrP07309 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtrP07309 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtrP07309 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtrP07309 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtrP07309 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtrP07309 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtrP07309 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms