Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgamP05555 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgamP05555 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgamP05555 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgamP05555 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms