Protein–RNA interactions for Protein: P01806

Ig heavy chain V region 441, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01806 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01806 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01806 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01806 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01806 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01806 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01806 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01806 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01806 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01806 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01806 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01806 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01806 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01806 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01806 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01806 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01806 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01806 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01806 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01806 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01806 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01806 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01806 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01806 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01806 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01806 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01806 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01806 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01806 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01806 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms