Protein–RNA interactions for Protein: P01803

Ig heavy chain V region AMPC1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01803 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01803 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01803 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
P01803 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01803 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01803 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01803 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01803 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01803 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01803 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01803 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01803 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01803 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01803 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01803 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01803 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01803 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01803 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01803 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01803 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01803 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01803 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01803 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01803 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01803 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01803 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01803 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01803 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01803 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01803 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01803 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01803 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01803 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01803 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01803 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01803 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01803 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01803 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01803 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01803 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms