Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01727 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01727 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01727 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01727 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01727 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01727 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01727 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01727 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01727 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01727 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01727 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01727 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01727 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01727 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01727 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01727 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01727 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01727 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01727 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01727 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01727 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01727 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01727 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01727 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01727 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01727 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01727 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01727 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01727 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01727 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01727 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01727 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01727 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01727 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01727 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01727 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01727 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01727 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01727 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01727 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01727 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01727 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01727 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01727 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01727 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01727 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01727 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01727 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01727 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01727 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01727 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01727 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01727 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01727 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01727 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01727 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01727 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01727 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01727 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01727 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01727 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01727 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01727 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01727 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01727 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01727 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01727 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01727 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01727 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01727 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01727 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01727 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01727 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01727 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01727 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01727 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01727 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01727 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01727 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01727 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01727 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01727 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01727 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01727 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms