Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01724 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01724 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01724 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01724 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01724 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01724 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01724 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01724 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01724 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01724 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01724 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01724 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01724 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01724 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01724 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01724 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01724 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01724 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01724 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01724 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01724 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01724 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01724 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01724 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01724 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01724 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01724 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01724 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01724 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01724 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01724 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01724 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01724 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01724 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01724 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01724 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01724 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01724 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01724 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01724 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01724 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01724 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01724 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01724 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01724 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01724 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01724 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01724 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01724 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01724 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01724 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01724 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01724 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01724 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01724 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01724 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01724 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01724 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01724 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01724 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01724 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01724 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01724 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01724 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01724 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01724 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01724 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01724 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01724 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01724 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms