Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01643 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01643 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01643 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01643 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01643 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01643 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01643 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01643 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01643 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01643 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01643 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01643 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01643 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01643 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01643 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01643 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01643 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01643 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01643 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01643 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01643 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01643 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01643 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01643 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01643 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01643 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01643 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01643 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01643 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01643 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01643 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01643 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01643 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01643 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01643 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01643 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01643 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01643 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01643 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01643 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01643 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01643 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01643 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01643 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01643 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01643 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01643 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01643 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01643 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01643 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01643 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01643 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01643 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01643 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01643 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01643 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01643 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01643 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01643 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01643 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01643 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01643 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01643 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01643 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01643 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01643 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01643 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01643 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms