Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01638 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01638 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01638 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01638 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01638 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01638 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01638 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01638 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01638 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01638 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01638 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01638 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01638 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01638 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01638 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01638 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01638 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01638 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01638 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01638 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01638 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01638 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01638 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01638 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01638 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01638 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01638 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01638 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01638 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01638 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01638 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01638 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01638 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01638 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01638 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
P01638 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01638 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01638 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01638 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01638 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01638 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01638 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01638 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01638 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01638 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
P01638 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01638 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
P01638 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01638 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01638 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01638 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01638 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01638 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms