Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna1P01572 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms