Protein–RNA interactions for Protein: P00405

Mtco2, Cytochrome c oxidase subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco2P00405 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms