Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lancl1O89112 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lancl1O89112 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lancl1O89112 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lancl1O89112 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lancl1O89112 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms