Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Setdb1O88974 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Setdb1O88974 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms