Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp23O88676 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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