Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pak1O88643 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pak1O88643 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pak1O88643 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pak1O88643 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pak1O88643 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1O88643 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1O88643 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1O88643 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pak1O88643 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1O88643 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pak1O88643 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pak1O88643 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms