Protein–RNA interactions for Protein: O88531

Ppt1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt1O88531 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt1O88531 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt1O88531 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms