Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nid2O88322 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nid2O88322 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nid2O88322 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nid2O88322 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nid2O88322 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nid2O88322 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nid2O88322 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms