Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm10509O88255 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm10509O88255 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm10509O88255 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm10509O88255 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm10509O88255 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10509O88255 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10509O88255 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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