Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clec11aO88200 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec11aO88200 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms