Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly86O88188 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly86O88188 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly86O88188 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly86O88188 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly86O88188 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly86O88188 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms