Protein–RNA interactions for Protein: O70548

Tcap, Telethonin, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcapO70548 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcapO70548 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcapO70548 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcapO70548 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcapO70548 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcapO70548 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcapO70548 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcapO70548 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcapO70548 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcapO70548 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcapO70548 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcapO70548 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcapO70548 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcapO70548 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcapO70548 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TcapO70548 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TcapO70548 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TcapO70548 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TcapO70548 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TcapO70548 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TcapO70548 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TcapO70548 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TcapO70548 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TcapO70548 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TcapO70548 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TcapO70548 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TcapO70548 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TcapO70548 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TcapO70548 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TcapO70548 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TcapO70548 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TcapO70548 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TcapO70548 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TcapO70548 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TcapO70548 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms