Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd70O55237 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd70O55237 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd70O55237 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd70O55237 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd70O55237 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd70O55237 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd70O55237 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd70O55237 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd70O55237 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd70O55237 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd70O55237 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd70O55237 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd70O55237 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd70O55237 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd70O55237 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd70O55237 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd70O55237 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd70O55237 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd70O55237 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd70O55237 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd70O55237 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cd70O55237 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd70O55237 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd70O55237 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd70O55237 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd70O55237 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd70O55237 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd70O55237 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd70O55237 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cd70O55237 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd70O55237 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd70O55237 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd70O55237 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd70O55237 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cd70O55237 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd70O55237 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd70O55237 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd70O55237 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd70O55237 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd70O55237 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd70O55237 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd70O55237 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd70O55237 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd70O55237 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms