Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp10O55123 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp10O55123 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms