Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Dsg2O55111 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg2O55111 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg2O55111 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms