Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn20O55082 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn20O55082 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms