Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nck2O55033 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nck2O55033 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nck2O55033 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck2O55033 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck2O55033 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck2O55033 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nck2O55033 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nck2O55033 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck2O55033 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nck2O55033 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nck2O55033 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nck2O55033 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nck2O55033 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nck2O55033 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nck2O55033 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms