Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfkbieO54910 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfkbieO54910 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfkbieO54910 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms