Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf12O54907 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf12O54907 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms