Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brs3O54798 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brs3O54798 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brs3O54798 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brs3O54798 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brs3O54798 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brs3O54798 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brs3O54798 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brs3O54798 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brs3O54798 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brs3O54798 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms