Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5r2O35926 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdk5r2O35926 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk5r2O35926 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms